火影忍者手游中秘卷系统是提升战力和战斗策略的重要环节，不同类型的秘卷通过升级可显著增强效果。秘卷分为通用型和专属型，通用秘卷如霸体（阴愈伤灭）、雷电击、真空波等可通过常规玩法获取并升级，专属秘卷则需特定忍者激活，如秽土鼬携带幻术·此处非之术可转变为幻术·伊邪那美，宇智波斑携带木遁·一字连柱会强化效果。秘卷升级需消耗对应碎片，最高可提升至10级，每级强化属性并缩短冷却时间。
通用秘卷中，霸体是决斗场核心选择，提供受击免控效果，升级后持续时间延长且冷却缩减。雷电击改版后支持受击释放，长按可触发多段闪电攻击，升级提升伤害与命中范围。风遁·真空波每级增加龙卷数量，满级可同时释放三道旋风。火遁·烈炎弹通过多次释放叠加灼烧效果，升级后持续伤害显著提高。这些秘卷需通过小队突袭、活动或商城礼包获取碎片，优先升满10级能最大化实战收益。
专属秘卷与忍者机制深度绑定，如白面具宇智波带土携带忍体术·反会变为宇智波反弹，柱间使用木遁·扦插之术可改变攻击形态。此类秘卷需先获取对应忍者，再通过秘卷碎片激活或升级。由于专属效果独特，建议根据主力忍者培养方向针对性投入资源。部分稀有专属秘卷如时空间忍术需通过限时活动或直购获取，优先级低于通用秘卷。
小队突袭开三倍奖励能高效产出碎片，丰饶之间和生存挑战等副本也会随机掉落。战力玩家建议长期保持三倍小队突袭以积累资源，非战力玩家可优先升满关键秘卷后停用倍率。需注意秘卷属性洗炼需消耗洗练石，普通洗练可能产生瑕疵属性，金币洗练能保证完美提升，但成本较高。
秘卷系统需长期规划，新手应优先将霸体、雷电击等通用秘卷升至满级，再逐步收集专属秘卷。升级过程中需平衡资源分配，避免过度消耗金币影响忍者招募。由于秘卷效果直接带入公平决斗场，即使是新手也应重视基础秘卷等级，避免因属性差距影响对战体验。
